El hallazgo ha sido descrito como "el avance más importante en décadas" en la investigación de esta enfermedad.
El descubrimiento, llevado a cabo por un consorcio de científicos estadounidenses y británicos, ofrece nuevas esperanzas para los más de 2,5 millones de personas en el mundo que padecen el trastorno.
"Absolutamente es un hito" dijo la doctora Liliana Patrucco, del Centro de Esclerosis Múltiple del Hospital Italiano de Buenos Aires, Argentina.
"Si bien se sabe que esta no es una enfermedad hereditaria, siempre se habló de una susceptibilidad genética".
La EM es una enfermedad neurodegenerativa del sistema nervioso central que puede ocasionar desde debilidad muscular moderada hasta invalidez parcial o total en los casos más severos.
Hasta ahora de desconocen las causas de este trastorno incurable.
Según los investigadores, los dos genes recientemente identificados, llamados IL7R-alpha y IL2R-alpha, pueden aumentar el riesgo de padecer EM en un 30%.
El descubrimiento no conducirá de inmediato a nuevas pruebas o tratamientos, ya que hay más de 100 genes involucrados en la EM.
Sin embargo, los científicos esperan que muy pronto puedan identificarlos a todos.
Los investigadores, que publican el estudio en la Revista de Medicina de Nueva Inglaterra y la revista Nature Genetics, utilizaron la técnica más moderna de escáner genético para analizar las variaciones genéticas en 12.360 personas.
Los resultados revelaron que las personas que tienen alguna de las dos variaciones genéticas, tienen más nriesgo de padecer la enfermedad.
Tal como señalan los expertos, aunque el hallazgo representa únicamente un pequeño aumento en el riesgo de EM, es un "hito" en la investigación de la enfermedad.
"Este descubrimiento pone fin a 30 años de total frustración", afirma el doctor Stephen Sawcer, de la Universidad de Cambridge, uno de los autores del estudio.
"Pero ahora finalmente contamos con la tecnología necesaria para identificar estas variantes", agrega.
Tal como explican los científicos, una prueba para identificar uno de los genes no revelaría nada sobre los riesgos que la persona tiene de desarrollar la enfermedad.
Esto debido a que se calcula que hay entre 50 y 100 genes que representan un riesgo adicional.
El hallazgo, dicen los investigadores, es importante porque abre la puerta para la identificación de más genes en los próximos años.
Una vez que se conozcan más genes de EM, los científicos creen que se podrá identificar a la gente que los porta y analizar qué otros factores podrían estar causando esta enfermedad.